Zentrale Technologie- und Serviceeinrichtungen

Anfang 2016 hat das FLI eine „Core“-Struktur eingerichtet, in der die Facility- und Serviceeinheiten unabhängig von den einzelnen Forschungsgruppen organisiert sind. Einige Technologien (z.B. Sequenzierung, Massenspektrometrie) hatten sich im Laufe der Jahre von einer gruppeninternen Methodik zu halbautonomen Substrukturen entwickelt, die durch die vernetzte Forschungsstruktur am Institut und gruppenübergreifende Projekte allen Forschungsgruppen zur Verfügung gestellt werden sollten.

Um die Effizienz und Transparenz für alle Technologienutzer, für das Facility-Personal und die damit verbundenen, notwendigen administrativen Prozesse am FLI zu erhöhen, wurden wissenschaftliche Technologie- und Serviceeinrichtungen, sogenannte „Core Facilities und Services“ als unabhängige Einheiten aus den Forschungsgruppen ausgegliedert. Gleichzeitig wurden technologische Einrichtungen, die für die wissenschaftliche Ausrichtung des FLI geringe Relevanz hatten (Röntgen-Kristallographie und NMR-Spektrometrie), geschlossen.

Die Core Facilities (CF) werden von je einem CF Manager betreut. Ihre Aktivitäten und Entwicklung betreut ein Gruppenleiter als „Scientific Supervisor“, um technologische Entwicklungen frühzeitig abzuschätzen und erkennen zu können. Die Animal Facilities werden separat betrieben, da sie eine komplexere Organisationsstruktur aufweisen. Darüber hinaus gibt es wissenschaftliche Services (Core Services, CS), die – unterstützt von CS Managern – direkt vom Head of Core (HC) geleitet werden.

Die Technologie- und Serviceeinrichtungen leisten am FLI einen erheblichen Beitrag zu den Forschungsartikeln, im Zeitraum von 2016 bis 2018 beispielweise zu 54 % aller peer-reviewed Veröffentlichungen.

[Translate to deutsch:] Overview Core Facilities & Services

Überblick über zentrale Technologie- und Serviceeinrichtungen

Publikationen

(seit 2016)

2018

Cell-based RNAi screening and high-content analysis in primary calvarian osteoblasts applied to identification of osteoblast differentiation regulators.
Ahmad M, Kroll T, Jakob J, Rauch A, Ploubidou A, Tuckermann J
Sci Rep 2018, 8(1), 14045
A new RelB-dependent CD117+ CD172a+ murine dendritic cell subset preferentially induces Th2 differentiation and supports airway hyperresponses in vivo.
Andreas N, Riemann M, Castro CN, Groth M, Koliesnik I, Engelmann C, Sparwasser T, Kamradt T, Haenold R, Weih F
Eur J Immunol 2018, 48(6), 923-36
Transcriptomic alterations during ageing reflect the shift from cancer to degenerative diseases in the elderly.
Aramillo Irizar P, Schäuble S, Esser D, Groth M, Frahm C, Priebe S, Baumgart M, Hartmann N, Marthandan S, Menzel U, Müller J, Schmidt S, Ast V, Caliebe A, König R, Krawczak M, Ristow M, Schuster S, Cellerino A, Diekmann S, Englert C, Hemmerich P, Sühnel J, Guthke R, Witte OW, Platzer M, Ruppin E, Kaleta C
Nat Commun 2018, 9(1), 327
Naked mole-rat transcriptome signatures of socially suppressed sexual maturation and links of reproduction to aging.
Bens* M, Szafranski* K, Holtze S, Sahm A, Groth M, Kestler HA, Hildebrandt** TB, Platzer** M
BMC Biol 2018, 16(1), 77 * equal contribution, ** co-senior authors
Spatial tissue proteomics quantifies inter- and intra-tumor heterogeneity in hepatocellular carcinoma.
Buczak* K, Ori* A, Kirkpatrick JM, Holzer K, Dauch D, Roessler S, Endris V, Lasitschka F, Parca L, Schmidt A, Zender L, Schirmacher P, Krijgsveld J, Singer** S, Beck** M
Mol Cell Proteomics 2018, 17(4), 810-25 * equal contribution, ** co-corresponding authors
On the S-layer of Thermus thermophilus and the assembling of its main protein SlpA.
Farci D, Farci SF, Esposito F, Tramontano E, Kirkpatrick J, Piano D
Biochim Biophys Acta 2018, 1860(8), 1554-62
Integrative analysis of differentially expressed genes and miRNAs predicts complex T3-mediated protective circuits in a rat model of cardiac ischemia reperfusion.
Forini F, Nicolini G, Kusmic C, D'Aurizio R, Rizzo M, Baumgart M, Groth M, Doccini S, Iervasi G, Pitto L
Sci Rep 2018, 8(1), 13870
The eukaryotic linear motif resource - 2018 update.
Gouw M, Michael S, Sámano-Sánchez H, Kumar M, Zeke A, Lang B, Bely B, Chemes LB, Davey NE, Deng Z, Diella F, Gürth CM, Huber AK, Kleinsorg S, Schlegel LS, Palopoli N, Roey KV, Altenberg B, Reményi A, Dinkel H, Gibson TJ
Nucleic Acids Res 2018, 46(D1), D428-34
Molecular mechanisms of photoadaptation of photosystem I supercomplex of in an evolutionary cyanobacterial/algal intermediate.
Haniewicz P, Abram M, Nosek L, Kirkpatrick J, El-Mohsnawy E, Janna Olmos JD, Kouril R, Kargul JM
Plant Physiol 2018, 176(2), 1433-51
Conformational µ-conotoxin PIIIA isomers revisited: The impact of cysteine pairing on disulfide bond assignment and structure elucidation.
Heimer P, Tietze AA, Bäuml CA, Resemann A, Mayer FJ, Suckau D, Ohlenschläger O, Tietze D, Imhof D
Anal Chem 2018, 90(5), 3321-7