Zentrale Technologie- und Serviceeinrichtungen
Anfang 2016 hat das FLI eine „Core“-Struktur eingerichtet, in der die Facility- und Serviceeinheiten unabhängig von den einzelnen Forschungsgruppen organisiert sind. Einige Technologien (z.B. Sequenzierung, Massenspektrometrie) hatten sich im Laufe der Jahre von einer gruppeninternen Methodik zu halbautonomen Substrukturen entwickelt, die durch die vernetzte Forschungsstruktur am Institut und gruppenübergreifende Projekte allen Forschungsgruppen zur Verfügung gestellt werden sollten.
Um die Effizienz und Transparenz für alle Technologienutzer, für das Facility-Personal und die damit verbundenen, notwendigen administrativen Prozesse am FLI zu erhöhen, wurden wissenschaftliche Technologie- und Serviceeinrichtungen, sogenannte „Core Facilities und Services“ als unabhängige Einheiten aus den Forschungsgruppen ausgegliedert. Gleichzeitig wurden technologische Einrichtungen, die für die wissenschaftliche Ausrichtung des FLI geringe Relevanz hatten (Röntgen-Kristallographie und NMR-Spektrometrie), geschlossen.
Die Core Facilities (CF) werden von je einem CF Manager betreut. Ihre Aktivitäten und Entwicklung betreut ein Gruppenleiter als „Scientific Supervisor“, um technologische Entwicklungen frühzeitig abzuschätzen und erkennen zu können. Die Animal Facilities werden separat betrieben, da sie eine komplexere Organisationsstruktur aufweisen. Darüber hinaus gibt es wissenschaftliche Services (Core Services, CS), die – unterstützt von CS Managern – direkt vom Head of Core (HC) geleitet werden.
Die Technologie- und Serviceeinrichtungen leisten am FLI einen erheblichen Beitrag zu den Forschungsartikeln, im Zeitraum von 2016 bis 2018 beispielweise zu 54 % aller peer-reviewed Veröffentlichungen.
Überblick über zentrale Technologie- und Serviceeinrichtungen
Publikationen
(seit 2016)
2024
- The Aging Synapse: An Integrated Proteomic And Transcriptomic Analysis
Caterino* C, Ugolini* M, Durso W, Jevdokimenko K, Groth M, Riege K, Görlach M, Fornasiero E, Ori A, Hoffmann S, Cellerino A
bioRxiv 2024, https://doi.org/10.1101/2024.12. * equal contribution - Optimized Automated Workflow for BioID Improves Reproducibility and Identification of Protein-Protein Interactions.
Cirri E, Knaudt H, Di Fraia D, Pömpner N, Rahnis N, Heinze I, Ori** A, Dau** T
J Proteome Res 2024 (epub ahead of print) ** co-corresponding authors - Amyloid beta precursor protein contributes to brain aging and learning decline in short-lived turquoise killifish (Nothobranchius furzeri)
E.M.de Bakker D, Mihaljević M, Gharat K, Richter Y, Bagnoli S, van Bebber F, Adam L, Shamim-Schulze F, Ohlenschläger O, Bens M, Cirri E, Antebi A, Matić I, Schneider A, Schmid B, Cellerino A, Kirstein J, Riccardo Valenzano D
bioRxiv 2024, https://doi.org/10.1101/2024.10. - Master corepressor inactivation through multivalent SLiM-induced polymerization mediated by the oncogene suppressor RAI2.
Goradia N, Werner S, Mullapudi E, Greimeier S, Bergmann L, Lang A, Mertens H, Węglarz A, Sander S, Chojnowski G, Wikman H, Ohlenschläger O, von Amsberg G, Pantel K, Wilmanns M
Nat Commun 2024, 15(1), 5241 - Impact of inflammatory preconditioning on murine microglial proteome response induced by focal ischemic brain injury.
Helbing DL, Haas F, Cirri E, Rahnis N, Dau TTD, Kelmer Sacramento E, Oraha N, Böhm L, Lajqi T, Fehringer P, Morrison H, Bauer R
Front Immunol 2024, 15, 1227355 - Denervation alters the secretome of myofibers and thereby affects muscle stem cell lineage progression and functionality.
Henze H, Hüttner SS, Koch P, Schüler SC, Groth M, von Eyss B, von Maltzahn J
NPJ Regen Med 2024, 9(1), 10 - Acetylation-induced proteasomal degradation of the activated glucocorticoid receptor limits hormonal signaling.
Iyer-Bierhoff A, Wieczorek M, Peter SM, Ward D, Bens M, Vettorazzi S, Guehrs KH, Tuckermann JP, Heinzel T
iScience 2024, 27(2), 108943 - Nonlinear DNA methylation trajectories in aging male mice.
Olecka* M, van Bömmel* A, Best L, Haase M, Foerste S, Riege K, Dost T, Flor S, Witte OW, Franzenburg S, Groth M, von Eyss B, Kaleta C, Frahm C, Hoffmann S
Nat Commun 2024, 15(1), 3074 * equal contribution - The Greenland shark (Somniosus microcephalus) genome provides insights into extreme longevity
Sahm A, Cherkasov* A, Liu* H, Voronov D, Siniuk K, Schwarz R, Ohlenschlaeger O, Foerste S, Bens M, Groth M, Goerlich I, Paturej S, Klages S, Braendl B, Olsen J, Bushnell P, Bech Poulsen A, Ferrando S, Garibaldi F, Lorenzo Drago D, Terzibasi Tozzini E, Mueller FJ, Fischer M, Kretzmer H, Domenici** P, Fleng Steffensen** J, Cellerino** A, Hoffmann** S
bioRxiv 2024, 10.1101/2024.09.09.611499 * equal contribution, ** co-corresponding authors - Hydra has mammal-like mutation rates facilitating fast adaptation despite its nonaging phenotype.
Sahm A, Riege K, Groth M, Bens M, Kraus J, Fischer M, Kestler H, Englert C, Schaible R, Platzer M, Hoffmann S
Genome Res 2024, 34(12), 2217-28