Teilbereich 3: Genetik und Epigenetik des Alterns

Der Schwerpunkt von Teilbereich 3 liegt auf genetischen und epigenetischen Determinanten der Lebens- und Gesundheitsspanne sowie des Alterns bei Fischen, Nagetieren und Menschen. Diese Forschungsrichtung baut auf der Expertise des Instituts in der vergleichenden und funktionellen Genomik auf.

Die Forschung wird durch fünf Schwerpunktbereiche definiert:

  • vergleichende Genomik in kurz- und langlebigen Modellen des Alterns,
  • Genomik in N. furzeri,
  • Epigenetik des Alterns,
  • Nicht-kodierende RNAs im Alterungsprozess,
  • vergleichende Transkriptomik des Alterns.

Forschungsfokus Teilbereich 3.

Um die Ursachen des Alterns zu verstehen, werden vergleichende Genomanalysen in kurz- und langlebigen Modellsystemen durchgeführt. Die funktionelle Genomik soll dabei neue Signalwege identifizieren, die am Altern eines Organismus beteiligt sind und die funktionelle Relevanz genetischer und epigenetischer Veränderungen validieren, die während des Alterns auftreten. Außerdem werden genetische Risikofaktoren für die Entstehung altersbedingter Krankheiten identifiziert und funktional getestet. In der Zukunft werden im Teilbereich Veränderungen in den Wechselwirkungen zwischen Wirt und Mikrobiota während des Alterns untersucht und wie diese die klonale Mutation und epigenetische Veränderungen durch Stoffwechselprodukte und andere Signale beeinflussen.

Publikationen

(seit 2016)

2024

  • Comprehensive transcriptome analysis reveals altered mRNA splicing and post-transcriptional changes in the aged mouse brain.
    Kumar NH, Kluever V, Barth E, Krautwurst S, Furlan M, Pelizzola M, Marz M, Fornasiero EF
    Nucleic Acids Res 2024, 52(6), 2865-85
  • Single-cell sequencing analysis unravels genes/pathways regulating vertebrate aging
    Meng Y
    Dissertation 2024, Jena, Germany
  • Exploring the impact of primer length on efficient gene detection via high-throughput sequencing.
    Micheel J, Safrastyan A, Aron F, Wollny D
    Nat Commun 2024, 15(1), 5858
  • Polyamines sustain epithelial regeneration in aged intestines by modulating protein homeostasis
    Minetti A, Omrani O, Brenner C, Allies G, Imada S, Rösler J, Khawaled S, Cansiz F, W.Meckelmann S, Gebert N, Heinze I, Lu J, Spengler K, Rasa M, Heller R, Yilmaz O, Tasdogan A, Neri F, Ori A
    bioRxiv 2024, https://doi.org/10.1101/2024.07.
  • Sex chromosome turnover in African annual killifishes of the genus Nothobranchius
    Monika H, Pablo M, Anna CV, Ahmed AR, Sergey AS, Tomáš P, Marie A, Karolína J, Jana Š, Nikolas T, Marek J, Matyáš H, Liehr T, Martin R, Eugene YK, Petr R, Englert C, Petr N, Sember A
    bioRxiv 2024, https://doi.org/10.1101/2024.03.
  • Surface microlayer-mediated virome dissemination in the Central Arctic.
    Rahlff J, Westmeijer G, Weissenbach J, Antson A, Holmfeldt K
    Microbiome 2024, 12(1), 218
  • Viral challenges and adaptations between Central Arctic Ocean and atmosphere
    Rahlff J, Westmeijer G, Weissenbach J, Antson A, Holmfeldt K
    bioRxiv 2024, https://doi.org/10.1101/2024.03.
  • PAPAS promotes differentiation of mammary epithelial cells and suppresses breast carcinogenesis.
    Ren S, Bai F, Schnell V, Stanko C, Ritsch M, Schenk T, Barth E, Marz M, Wang B, Pei XH, Bierhoff H
    Cell Rep 2024, 43(1), 113644
  • Endogenous viral elements: insights into data availability and accessibility.
    Ritsch M, Brait N, Harvey E, Marz M, Lequime S
    Virus Evol 2024, 10(1), veae099
  • Endogenous Bornavirus-like Elements in Bats: Evolutionary Insights from the Conserved Riboviral L-Gene in Microbats and Its Antisense Transcription in Myotis daubentonii.
    Ritsch M, Eulenfeld T, Lamkiewicz K, Schoen A, Weber F, Hölzer** M, Marz** M
    Viruses 2024, 16(8), 1210 ** co-corresponding authors