Teilbereich 3: Genetik und Epigenetik des Alterns
Der Schwerpunkt von Teilbereich 3 liegt auf genetischen und epigenetischen Determinanten der Lebens- und Gesundheitsspanne sowie des Alterns bei Fischen, Nagetieren und Menschen. Diese Forschungsrichtung baut auf der Expertise des Instituts in der vergleichenden und funktionellen Genomik auf.
Die Forschung wird durch fünf Schwerpunktbereiche definiert:
- vergleichende Genomik in kurz- und langlebigen Modellen des Alterns,
- Genomik in N. furzeri,
- Epigenetik des Alterns,
- Nicht-kodierende RNAs im Alterungsprozess,
- vergleichende Transkriptomik des Alterns.
Forschungsfokus Teilbereich 3.
Um die Ursachen des Alterns zu verstehen, werden vergleichende Genomanalysen in kurz- und langlebigen Modellsystemen durchgeführt. Die funktionelle Genomik soll dabei neue Signalwege identifizieren, die am Altern eines Organismus beteiligt sind und die funktionelle Relevanz genetischer und epigenetischer Veränderungen validieren, die während des Alterns auftreten. Außerdem werden genetische Risikofaktoren für die Entstehung altersbedingter Krankheiten identifiziert und funktional getestet. In der Zukunft werden im Teilbereich Veränderungen in den Wechselwirkungen zwischen Wirt und Mikrobiota während des Alterns untersucht und wie diese die klonale Mutation und epigenetische Veränderungen durch Stoffwechselprodukte und andere Signale beeinflussen.
Publikationen
(seit 2016)
2025
- Analysis of microRNA expression reveals convergent evolution of the molecular control of diapause in annual killifishes.
Barth* E, Baumgart* M, Dolfi* L, Cui R, Groth M, Ripa R, Savino A, Valenzano DR, Platzer M, Marz** M, Cellerino** A
Front Genet 2025, 16, 1583989 * equal contribution, ** co-corresponding authors - Translational Remodeling of the Synaptic Proteome During Aging.
Caterino C, Ugolini M, Durso W, Jevdokimenko K, Groth M, Riege K, Görlach M, Fornasiero E, Ori A, Hoffmann S, Cellerino A
Aging Cell 2025 (epub ahead of print) - Nerve Growth Factor Receptor (NGFR/p75NTR) of the Small-Spotted Catshark (Scyliorhinus canicula): Evolutionary Conservation and Brain Function.
Chiavacci E, Camera R, Costa M, Fronte B, Tozzini ET, Cellerino A
J Comp Neurol 2025, 533(4), e70049 - Altered translation elongation contributes to key hallmarks of aging in the killifish brain.
Di Fraia* D, Marino* A, Lee* JH, Kelmer Sacramento E, Baumgart M, Bagnoli S, Balla T, Schalk F, Kamrad S, Guan R, Caterino C, Giannuzzi C, Tomaz da Silva P, Sahu AK, Gut H, Siano G, Tiessen M, Terzibasi-Tozzini E, Fornasiero EF, Gagneur J, Englert C, Patil KR, Correia-Melo C, Nedialkova DD, Frydman** J, Cellerino** A, Ori** A
Science 2025, 389(6759), eadk3079 * equal contribution, ** co-senior authors - Wilms' tumor 1 impairs apoptotic clearance of fibroblasts in distal fibrotic lung lesions.
Ediga HH, Vemulapalli CP, Sontake V, Patel PK, Miyazaki H, Popov D, Jensen MB, Jegga AG, Huang SK, Englert C, Schedl A, Gupta N, McCormack FX, Madala SK
J Clin Invest 2025, 135(15), e188819 - AnchoRNA: Full virus genome alignments through conserved anchor regions
Eulenfeld** T, Triebel S, Marz** M
bioRxiv 2025, https://doi.org/10.1101/2025.01. ** co-corresponding authors - Multiple Origins of Sex Chromosomes in Nothobranchius Killifishes.
Hospodářská M, Mora P, Voleníková AC, Al-Rikabi A, Altmanová M, Simanovsky SA, Tolar N, Pavlica T, Janečková K, Štundlová J, Bobryshava K, Jankásek M, Hiřman M, Liehr T, Reichard M, Krysanov EY, Ráb P, Englert C, Nguyen P, Sember A
Mol Ecol 2025, 34(16), e70029 - Analysis of different strains of the turquoise killifish identify transcriptomic signatures associated with heritable lifespan differences.
Mazzetto M, Reichwald K, Koch P, Groth M, Cellerino A
J Gerontol A Biol Sci Med Sci 2025, 80(7), glae255 - diffONT: predicting methylation-specific PCR biomarkers based on nanopore sequencing data for clinical application
Meyer** D, Barth E, Wiehle L, Marz** M
bioRxiv 2025, https://doi.org/10.1101/2025.02. ** co-corresponding authors - Multiple Wnt signaling pathways direct epithelial tubule interconnection in the regenerating zebrafish kidney
N.Kamei C, G.B.Sampson W, Albertz C, Aries O, Wolf A, M.Upadhyay R, M.Hughes S, Schenk H, Bonnet F, W.Draper B, W.McCracken K, K.Marciano D, Oxburgh L, A.Drummond I
bioRxiv 2025, https://doi.org/10.1101/2025.03.

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