Teilbereich 3: Genetik und Epigenetik des Alterns

Der Schwerpunkt von Teilbereich 3 liegt auf genetischen und epigenetischen Determinanten der Lebens- und Gesundheitsspanne sowie des Alterns bei Fischen, Nagetieren und Menschen. Diese Forschungsrichtung baut auf der Expertise des Instituts in der vergleichenden und funktionellen Genomik auf.

Die Forschung wird durch fünf Schwerpunktbereiche definiert:

  • vergleichende Genomik in kurz- und langlebigen Modellen des Alterns,
  • Genomik in N. furzeri,
  • Epigenetik des Alterns,
  • Nicht-kodierende RNAs im Alterungsprozess,
  • vergleichende Transkriptomik des Alterns.

Forschungsfokus Teilbereich 3.

Um die Ursachen des Alterns zu verstehen, werden vergleichende Genomanalysen in kurz- und langlebigen Modellsystemen durchgeführt. Die funktionelle Genomik soll dabei neue Signalwege identifizieren, die am Altern eines Organismus beteiligt sind und die funktionelle Relevanz genetischer und epigenetischer Veränderungen validieren, die während des Alterns auftreten. Außerdem werden genetische Risikofaktoren für die Entstehung altersbedingter Krankheiten identifiziert und funktional getestet. In der Zukunft werden im Teilbereich Veränderungen in den Wechselwirkungen zwischen Wirt und Mikrobiota während des Alterns untersucht und wie diese die klonale Mutation und epigenetische Veränderungen durch Stoffwechselprodukte und andere Signale beeinflussen.

Publikationen

(seit 2016)

2020

  • NR2F1 regulates regional progenitor dynamics in the mouse neocortex and cortical gyrification in BBSOAS patients.
    Bertacchi M, Romano AL, Loubat A, Tran Mau-Them F, Willems M, Faivre L, Khau van Kien P, Perrin L, Devillard F, Sorlin A, Kuentz P, Philippe C, Garde A, Neri F, Di Giaimo R, Oliviero S, Cappello S, D'Incerti L, Frassoni C, Studer M
    EMBO J 2020, 39(13), e104163
  • NF-κB signaling in tanycytes mediates inflammation-induced anorexia.
    Böttcher M, Müller-Fielitz H, Sundaram SM, Gallet S, Neve V, Shionoya K, Zager A, Quan N, Liu X, Schmidt-Ullrich R, Haenold R, Wenzel J, Blomqvist A, Engblom D, Prevot V, Schwaninger M
    Mol Metab 2020, 39, 101022
  • Identification of Undescribed Relb Expression Domains in the Murine Brain by New Relb:cre-katushka Reporter Mice.
    Engelmann C, Riemann M, Carlstedt S, Grimlowski R, Andreas N, Koliesnik I, Meier E, Austerfield P, Haenold R
    Dev Dyn 2020 (epub ahead of print)
  • miR-182-5p is an evolutionarily conserved Tbx5 effector that impacts cardiac development and electrical activity in zebrafish.
    Guzzolino E, Pellegrino M, Ahuja N, Garrity D, D'Aurizio R, Groth M, Baumgart M, Hatcher CJ, Mercatanti A, Evangelista M, Ippolito C, Tognoni E, Fukuda R, Lionetti V, Pellegrini M, Cremisi F, Pitto L
    Cell Mol Life Sci 2020, 77(16), 3215-29
  • PoSeiDon: a Nextflow pipeline for the detection of evolutionary recombination events and positive selection.
    Hölzer M, Marz M
    Bioinformatics 2020 (epub ahead of print)
  • Dichotomous Impact of Myc on rRNA Gene Activation and Silencing in B Cell Lymphomagenesis.
    Joshi* G, Eberhardt* AO, Lange L, Winkler R, Hoffmann S, Kosan C, Bierhoff H
    Cancers (Basel) 2020, 12(10), E3009. doi: 10.3390/cancers12103 * equal contribution
  • Reduced proteasome activity in the aging brain results in ribosome stoichiometry loss and aggregation.
    Kelmer Sacramento* E, Kirkpatrick* JM, Mazzetto* M, Baumgart M, Bartolome A, Di Sanzo S, Caterino C, Sanguanini M, Papaevgeniou N, Lefaki M, Childs D, Bagnoli S, Terzibasi Tozzini E, Di Fraia D, Romanov N, Sudmant PH, Huber W, Chondrogianni N, Vendruscolo M, Cellerino** A, Ori** A
    Mol Syst Biol 2020, 16(6), e9596 * equal contribution, ** co-corresponding authors
  • ADAM10 mediates ectopic proximal tubule development and renal fibrosis through Notch signalling.
    Li B, Zhu C, Dong L, Qin J, Xiang W, Davidson AJ, Feng S, Wang Y, Shen X, Weng C, Wang C, Zhu T, Teng L, Wang J, Englert C, Chen J, Jiang H
    J Pathol 2020 (epub ahead of print)
  • VIDHOP, viral host prediction with Deep Learning.
    Mock F, Viehweger A, Barth E, Marz M
    Bioinformatics 2020 (epub ahead of print)
  • Ontogenetic Pattern Changes of Nucleobindin-2/Nesfatin-1 in the Brain and Intestinal Bulb of the Short Lived African Turquoise Killifish.
    Montesano* A, Felice* ED, Leggieri A, Palladino A, Lucini C, Scocco P, Girolamo Pd, Baumgart** M, D'Angelo** L
    J Clin Med 2020, 9(1) * equal contribution, ** co-corresponding authors