CF Next Generation Sequencing
Die CF Next Generation Sequencing (NGS) bietet dem FLI und externen Kooperationspartnern umfassende Expertise und modernste Infrastruktur im Bereich der NGS-Technologien. Unser Ziel ist es, Forschende dabei zu unterstützen, biologische Fragestellungen auf Genom-, Transkriptom-, Epigenom- und Metagenom-Ebene mit hoher Präzision und Effizienz zu beantworten.
Wir begleiten Projekte entlang der gesamten experimentellen Pipeline – von der Beratung bei Versuchsdesign und Probenanforderungen über Library Preparation und Sequenzierung bis hin zur standardisierten Primärdatenaufbereitung. Weiterführende Analysen erfolgen in Kooperation mit der CF Life Science Computing und sind nicht Teil des Kerndienstleistungsangebots der CF NGS.
Anwendungsbereiche
- Genomik – Whole-Genome, Exom- und gezielte Sequenzierung
- Transkriptomik – bulk RNA-seq, Single-Cell RNA-seq, small RNA
- Epigenomik – Methylierungsanalysen (RRBS, WGBS), ATAC-seq
- Metagenomik und Mikrobiom
- Long-Read Sequenzierung
Technische Ausstattung
Sequenzierung
- Illumina NovaSeq 6000, NextSeq 1000, MiSeq
- Oxford Nanopore MinION Mk1B
Probenvorbereitung und Automation
- 10x Genomics Chromium X
- Beckman Coulter Biomek i7
- Covaris M220
- Diagenode Megaruptor
- Sage Science BluePippin
Qualitätskontrolle
- Agilent 2100 Bioanalyzer, 4200 Tapestation
- Thermo Scientific NanoDrop
