Forschungsgruppe Platzer

Genomanalyse:
Der Bauplan des Lebens

Die Forschungsgruppe Genomanalyse um Matthias Platzer beschäftigt sich mit den (Epi)genetischen Aspekten des Alterns. Mithilfe modernster Methoden können die im Erbmolekül DNA gespeicherten Informationen in kürzester Zeit gelesen und die Abfolge von Abermillionen DNA-Bausteinen bestimmt werden. Unsere Arbeitsgruppe nutzt diese Methoden, um sowohl die Erbinformation als auch die Prozesse zu beschreiben, die bspw. zur Produktion von Proteinen führen. Wir wollen verstehen, welche Rolle diese Prozesse beim Altern spielen.

Unser Ziel ist es, das komplette Erbgut (Genom) und die Summe aller in einer Zelle von DNA in RNA umgeschriebenen Geninformationen (Transkriptom) sowohl bei kurz- als auch langlebigen Modellorganismen zu bestimmen. Mit klinischen Partnern suchen wir nach (epi)genetischen Variationen, die die individuelle Veranlagung für ein gesundes Altern oder altersbedingte Erkrankungen bestimmen.

Kreuzung von zwei N. furzeri-Stämmen.
N. furzeri-Nachwuchs

Kontakt

Matthias Platzer
Gruppenleiter
+49 3641 65-6240
matthias.platzer@leibniz-fli.de

Patricia Möckel
Sekretariat
+49 3641 65-6240
patricia.moeckel@leibniz-fli.de


Ausgewählte Publikationen

  • Genetic Factors of the Disease Course After Sepsis: Rare Deleterious Variants Are Predictive.
    Taudien* S, Lausser* L, Giamarellos-Bourboulis EJ, Sponholz C, Schöneweck F, Felder M, Schirra LR, Schmid F, Gogos C, Groth S, Petersen BS, Franke A, Lieb W, Huse K, Zipfel PF, Kurzai O, Moepps B, Gierschik P, Bauer M, Scherag A, Kestler** HA, Platzer** M
    EBioMedicine 2016, 12, 227-38 * equal contribution, ** co-senior authors
  • Insights into Sex Chromosome Evolution and Aging from the Genome of a Short-Lived Fish.
    Reichwald* K, Petzold* A, Koch* P, Downie* BR, Hartmann* N, Pietsch S, Baumgart M, Chalopin D, Felder M, Bens M, Sahm A, Szafranski K, Taudien S, Groth M, Arisi I, Weise A, Bhatt SS, Sharma V, Kraus JM, Schmid F, Priebe S, Liehr T, Görlach M, Than ME, Hiller M, Kestler HA, Volff JN, Schartl M, Cellerino** A, Englert** C, Platzer** M
    Cell 2015, 163(6), 1527-38 * equal contribution, ** co-senior authors, featured in Cell Preview by Vanisha Lakhina and Coleen T. Murphy: Genome Sequencing Fishes out Longevity Genes. Cell. 2015 163(6):1312-3,Nature News by Ewen Callaway: Short-lived fish may hold clues to human age
  • The transcript catalogue of the short-lived fish Nothobranchius furzeri provides insights into age-dependent changes of mRNA levels.
    Petzold A, Reichwald K, Groth M, Taudien S, Hartmann N, Priebe S, Shagin D, Englert C, Platzer M
    BMC Genomics 2013, 14, 185
  • Finishing the euchromatic sequence of the human genome.
    International Human Genome Sequencing Consortium (...), Platzer M, Baumgart C, Förste S, Galgoczy P, Glöckner G, Görlich Y, Heinze I, Jahn N, Lagemann D, Lehmann R, Meier E, Michaelis E, Petz U, Reichwald K, Schilhabel M, Seitz K, Siddiqui R, Taudien S, Wen G, Werler D, (...)
    Nature 2004, 431(7011), 931-45
  • Widespread occurrence of alternative splicing at NAGNAG acceptors contributes to proteome plasticity.
    Hiller* M, Huse* K, Szafranski K, Jahn N, Hampe J, Schreiber S, Backofen R, Platzer M
    Nat Genet 2004, 36(12), 1255-7 * equal contribution